Las misiones empezaron a establecerse a partir de 1697 por el deseo de evangelizar a los pobladores. El padre jesuita Juan María de Salvatierra fue el fundador de la primera misión en Baja California y fue bautizada con el nombre de Misión de Nuestra Señora de Loreto. Durante el recorrido por la Ruta 1 es posible visitar las siguientes misiones que aún conservan su estructura o parte y en algunos casos también su interior.
Situadas en el municipio de Mulegé se encuentran la Misión de San Ignacio (1728 - 1840), asentada en un oasis en medio del desierto, actualmente es una de las mejor conservadas gracias a que fue construída con bloques de piedra volcánica y aún se puede apreciar en su interior el altar de madera labrada y chapa de oro así como la estatua de San Ignacio de Loyola - joya del arte religioso del Siglo XVIII ; la misión de Santa Rosalía de Mulegé (1705 - 1828) ha sido restaurada en diferentes épocas y aún se conservan sus características arquitectónicas exteriores más no el interior.
Las misiones empezaron a establecerse a partir de 1697 por el deseo de evangelizar a los pobladores. El padre jesuita Juan María de Salvatierra fue el fundador de la primera misión en Baja California y fue bautizada con el nombre de Misión de Nuestra Señora de Loreto. Durante el recorrido por la Ruta 1 es posible visitar las siguientes misiones que aún conservan su estructura o parte y en algunos casos también su interior.
Situadas en el municipio de Mulegé se encuentran la Misión de San Ignacio (1728 - 1840), asentada en un oasis en medio del desierto, actualmente es una de las mejor conservadas gracias a que fue construída con bloques de piedra volcánica y aún se puede apreciar en su interior el altar de madera labrada y chapa de oro así como la estatua de San Ignacio de Loyola - joya del arte religioso del Siglo XVIII ; la misión de Santa Rosalía de Mulegé (1705 - 1828) ha sido restaurada en diferentes épocas y aún se conservan sus características arquitectónicas exteriores más no el interior.
En 1972-1973 el Instituto Nacional de Antropología e Historia realizó trabajos de restauración a la Misión de San José Comondú (1708 -1827) especialmente a la bóveda de cañón corrido y en los muros. Por otro lado, dentro del Municipio de Comondú es posible visitar también la Misión San Luis Gonzaga Chiriyaqui (1740-1768).
Dentro del Municipio de Loreto se encuentran la Misión de Nuestra Señora de Loreto Conchó (1697- 1829), como se mencionó anteriormente, fue la primera misión que se estableció en Baja California. Dos años después de su construcción, a medida que la evangelización fue creciendo, permitió la construcción de un templo de piedra pero debido al terremoto de 1877, la estructura sufrió estragos. Hoy en día está reconstruida y es hogar del Museo de las Misiones.
La Misión de Nuestra Señora de La Paz Airapí (1720-1861) fue fundada en 1720 pero debido a la hostilidad indígena y la falta de agua, los misioneros se mudaron a lo que ahora es conocido como Todos Santos. La construcción del templo actual se realizó en 1861 y se le conoce como la Catedral de Nuestra de La Paz sede de la Diócesis de La Paz.
Por último, la Misión de Santiago de los Coras Aiñiní (1721-1725) que tomó su nombre de los Coras, pueblo indígena de la región, se le han hecho varias restauraciones ya que se ha visto afectada por fenómenos naturales y la Misión de San José del Cabo (1730-1840), fue la más sureña de las misiones jesuíticas y en ella se celebran actualmente festejos por la fundación del lugar así como celebraciones en honor a este Santo. Estas dos ubicadas en el Municipio de Los Cabos.